在唐高宗麟德元年（664年）的歷史記載中，玄奘法師對(duì)譯場(chǎng)的助手和弟子們這樣說：玄奘今年六十有五，必當(dāng)卒命于此伽藍(lán)，經(jīng)部甚大，每懼不終，人人努力加勤，勿辭勞苦。

在玄奘法師的一生中，他第一次發(fā)出了擔(dān)憂之辭。不久，他又對(duì)弟子們說的一段話幾乎可以看作是他的遺言：若無常后，汝等遣我宜從儉省，可以蘧蒢裹送，仍擇山澗僻處安置，勿近宮寺。不凈之身，宜須屏遠(yuǎn)。

同年正月初三，玄奘法師的弟子懇請(qǐng)玄奘翻譯《大寶積經(jīng)》。玄奘法師在勉強(qiáng)翻譯了幾行后，突然停了下來神色黯然地說：此經(jīng)部軸與《大般若》同，玄奘自量氣力不復(fù)辦此，死期已至，勢(shì)非賒遠(yuǎn)。說完這句話以后，玄奘法師從此絕筆。他表示，要把此后有限的歲月去為離開這個(gè)世界做準(zhǔn)備。

正月初八，玄奘法師的弟子玄覺法師夢(mèng)見一尊莊嚴(yán)高大的佛塔突然倒塌，他趕緊就去找玄奘法師。玄奘法師明確告訴他：非汝身事，此是吾滅謝之征。僅僅一天以后，正月初九，曾經(jīng)翻越過無數(shù)崇山峻嶺、滔滔江河的玄奘法師居然在屋子后面跨越一道小溝時(shí)摔了一跤。雖然只不過是稍微擦破了一點(diǎn)點(diǎn)皮，但玄奘法師卻從此倒下，病情急轉(zhuǎn)直下。

正月十六，玄奘的病情已經(jīng)十分嚴(yán)重，口里喃喃自語：吾眼前有白蓮花，大于盤，鮮凈可愛。第二天，玄奘又夢(mèng)見禪房里突然出現(xiàn)了成百上千的人，非常高大，身穿錦繡服裝，來回穿行，院子后面的山陵之間突然布滿了鮮艷的金幡、旗幟，林間奏響了各種各樣的音樂，門外停滿了裝飾華麗的車子，車子上裝滿了各種各樣的食物，來供養(yǎng)玄奘法師。玄奘法師一面說：玄奘未階此位，何敢輒受？一面卻還在進(jìn)食。弟子趕緊把玄奘法師叫醒，玄奘法師睜開眼睛，把自己剛才看見的事情告訴了身邊的玉華寺寺主慧德法師，這個(gè)寺主非常恭敬地玄奘法師的這些描述記下來，留給了后人。玄奘法師同時(shí)還對(duì)慧德法師說：玄奘一生已來所修?；?，準(zhǔn)斯相貌，欲似功不唐捐，信如佛教因果并不虛也。意思是說：我在夢(mèng)境當(dāng)中看到的這些現(xiàn)象，好像表明我這一輩子所修的?；蹧]有白費(fèi)。我確信，佛教因果不是虛妄。

在生命彌留之際，玄奘下令弟子把已經(jīng)翻譯完成的佛經(jīng)編一個(gè)目錄，看看翻譯了多少。玄奘法師又吩咐眾僧為他造像寫經(jīng)，廣為施舍，同時(shí)他按照佛教的戒律，把自己用的東西全部施舍給寺里的僧眾。

那么玄奘法師在人世間的最后時(shí)刻留下的遺言是什么？玄奘法師又是以一種什么樣的姿態(tài)圓寂的呢？

從文獻(xiàn)記載上來看，之后玄奘的病情穩(wěn)定了一段時(shí)間，或者是所謂的回光返照。在正月二十四日那天，玄奘法師讓一個(gè)叫宋法智的塑像工人在玉華寺的嘉壽殿豎起一個(gè)菩提像，把骨架搭好。他召集了所有身邊的翻譯佛經(jīng)的弟子，留下了在人世間最后的話：玄奘此毒身深可厭患，所做事畢，無宜久住。愿以所修?；刍厥┯星?，共諸有情同生睹史多天彌勒內(nèi)眷屬中奉事慈尊，佛下生時(shí)亦愿隨下廣作佛事，乃至無上菩提。玄奘法師意思是說自己的俗身是不凈的，已經(jīng)厭惡了，在這個(gè)世間所要做的事情已經(jīng)做完了，不必要再待著。我不是為個(gè)人修?；?，我修的這一切愿意把它回報(bào)給人世間仍然活著的人。我祈愿，我能跟大家一起上生到彌勒菩薩身邊，去奉侍彌勒菩薩。我發(fā)愿，當(dāng)彌勒佛下生的時(shí)候，我愿意跟著他下來廣作佛事，去追求無上菩提，追求最高的智慧。

在接下來的日子，玄奘法師幾乎不說話，只是不停地念誦佛經(jīng)，皈敬彌勒、如來，愿往生彌勒凈土。

二月初四夜開始，玄奘法師右手支撐著頭部，左手舒放在左腿之上，非常平緩地，右脅而臥，不動(dòng)半分。這是玄奘圓寂前肉身的最后姿態(tài)，我們看見臥佛就能想到這個(gè)姿勢(shì)。

二月初五夜半時(shí)分，他的弟子問玄奘法師：和上決定得生彌勒內(nèi)眾不？即弟子問玄奘，和上（和尚在佛經(jīng)中是個(gè)尊稱，但自己不能稱自己為和尚，只能稱貧僧或者小僧，而最尊敬的寫法應(yīng)該是作和上），您是不是已經(jīng)決定可以生到彌勒佛凈土呢？

玄奘法師回答：得生。

這是玄奘法師在這個(gè)世界上留下的最后兩個(gè)字。

玄奘法師圓寂的消息傳到長(zhǎng)安，舉國(guó)悲悼，唐高宗哀嘆：朕失國(guó)寶矣！甚至為了玄奘法師而罷朝數(shù)日。二月二十六日，唐高宗下旨，玄奘法師所有喪事費(fèi)用由朝廷負(fù)責(zé)。三月初六，又下令暫停翻譯工作，已經(jīng)完成的部分由政-府出資傳抄，尚未完成的交慈恩寺保管，不得遺失。

四月十四日，按照玄奘法師臨終前的心愿，將他葬于浐水之濱的白鹿原，當(dāng)時(shí)趕來送葬的人不計(jì)其數(shù)。唐高宗總章二年（669年），遷葬到樊川北原，并在當(dāng)?shù)貭I(yíng)造塔宇寺廟。唐中宗神龍?jiān)辏?05年），又下令在兩京，也就是長(zhǎng)安和洛陽各建造一座佛光寺，追謚玄奘為大遍覺法師。

在玄奘法師圓寂后一百八十年后的845年（唐武宗會(huì)昌五年），發(fā)生了中國(guó)佛教史上最大的一場(chǎng)法難會(huì)昌法難，統(tǒng)治者下令在全國(guó)范圍內(nèi)摧毀一切寺廟，淘汰僧尼。而就在這樣大規(guī)模的會(huì)昌法難中，長(zhǎng)安的慈恩寺也被明令保留了下來。這足以說明玄奘法師的功德和聲望。